Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
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