Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE3BQ13370 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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