Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SP140Q13342 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SP140Q13342 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SP140Q13342 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms