Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX3Q13185 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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