Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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CALCOCO2Q13137 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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CALCOCO2Q13137 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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CALCOCO2Q13137 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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CALCOCO2Q13137 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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CALCOCO2Q13137 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALCOCO2Q13137 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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