Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms