Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC1Q08554 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms