Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms