Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms