Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF17Q02223 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms