Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms