Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO4P61968 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms