Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DAP3P51398 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DAP3P51398 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms