Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLCP48506 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCLCP48506 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCLCP48506 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLCP48506 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLCP48506 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms