Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCR1P46094 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCR1P46094 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms