Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA4P35212 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA4P35212 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA4P35212 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA4P35212 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA4P35212 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA4P35212 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA4P35212 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA4P35212 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA4P35212 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA4P35212 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA4P35212 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA4P35212 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA4P35212 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA4P35212 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA4P35212 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms