Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms