Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT1P26358 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms