Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRDP23468 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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