Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CBSLP0DN79 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms