Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms