Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRPRAP08240 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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