Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms