Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CCNDBP1O95273 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CCNDBP1O95273 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CCNDBP1O95273 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CCNDBP1O95273 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CCNDBP1O95273 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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