Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIN3BO75182 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms