Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms