Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF4O60810 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms