Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms