Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP3Q9Y446 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKP3Q9Y446 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms