Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTX4Q9Y2E6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms