Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHORDC1Q9UHD1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms