Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms