Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms