Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms