Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFGAP3Q9NP61 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms