Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms