Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FYCO1Q9BQS8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms