Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms