Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC7Q96M83 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms