Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00615Q96LM1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms