Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP47Q96K76 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP47Q96K76 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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