Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms