Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN4Q92575 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms