Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCSTNQ92542 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms