Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms