Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms