Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms