Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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USP53Q70EK8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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USP53Q70EK8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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USP53Q70EK8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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USP53Q70EK8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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USP53Q70EK8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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USP53Q70EK8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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USP53Q70EK8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP53Q70EK8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
USP53Q70EK8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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