Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms