Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms